La mayoría de las especies de peces endémicos del estado de Oaxaca están en peligro de extinción a causa de la contaminación en los ríos y arroyos. Así lo aseguraron biólogos como Víctor Ortiz, quién además, señaló que otro de los factores que pone en riesgo a estos animales es la extracción de materiales pétreos de las corrientes de agua, así como el uso del vital líquido en campos de riego.Debido a los altos niveles de contaminación de los pricipales ríos del estado, las principales especies amenazadas son aquellas que habitan en la costa, los Chimalapas o Ixtlán. Ya que los arroyos donde se reproducen están directamente conectados a las principales corrientes de la entidad.Debido a la contaminación y a la actividad humana, el número de estos peces se ha reducido con el paso de los años. Lo que ha llevado a que muchas poblaciones de las diferentes especies queden aisladas o desaparezcan.La mayoría de peces endémicos de Oaxaca corren el riesgo de desaparecer, debido a la contaminación y la explotación de los recursos naturales en los principales ríos de la entidad. Al ser especies que solo se encuentran en pequeñas regiones de la entidad, muchas poblaciones de estos animales han quedado aisladas o directamente han desaparecido. Lo que en un futuro puede llevar a su extinción definitiva.